【YESLAB】一个能读懂所有细胞的AI医疗工具
一个能读懂所有细胞的AI医疗工具最近在医学领域,研究人员开发了一种由人工智能(AI)驱动的工具“scGen”,这个工具在单细胞级别研究疾病及其治疗方式非常有潜力。
目前scGen的论文已经发表于《Nature Methods》其研究显示,scGen能够帮助医疗人员直接学习并发现细胞应对疾病及治疗过程的反应,这样获得的数据会远超于实验过程。
scGen是一种生成性的深度学习模型,它参照了图像数据、序列数据和自然语言处理的思想,对细胞在疾病与治疗过程作用下的行为反应进行建模,使得这种细胞的反馈机制能够像数据一样在计算机上进行研究与模拟。其研究团队声明scGen是一个非常强大的单细胞事件生成器,能够对每个细胞的行为进行预测,也能通过可视化效果来发现基因表达空间中潜在的映射关系。
目前scGen仍然开源,如果你非常感兴趣可以到https://github.com/theislab/scgen
了解详细内容并试用。该团队声称下一步还会继续改进scGen,使其成为一个完全数据驱动的范式,增加其预测能力,以便能够对扰动组合进行研究,这或许对治疗癌症很有意义。不过就工具本身就已经足以改变我们的日常医疗方式,有了这样的工具,健康状态下的大型器官图谱能够即时呈现,医生就能够这以更好的方式尽确认器官的健康程度,为快速治疗提供了很好的参考。
scGen也是第一个预测样本外细胞反应的工具,这意味着如果使用捕获系统的扰动影响数据进行训练,就可能对不同的系统进行可靠的预测,可以说是具备了迁移学习的能力。慕尼黑技术大学的医疗研究人员表示:“我们第一次有机会对小鼠等生物的系统进行建模与生成数据,并利用这些数据训练的模型来预测与研究人类患者的类似疾病或治疗反应。”
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